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Cluster Lautaro

Para este Cluster, el principal recurso de cómputo es una GPU NVIDIA K40C con 2880 núcleos CUDA.

Tambien tiene 40 cores disponibles para procesamiento en CPU o Hibrido junto a la GPU.

Hay disponible 3 compiladores : GCC 7.3, LLVM 4.0 y NVV , este último es el que deben usar para trabajar o compilar código para CUDA tool kit.

Conexión al Cluster Lautaro

Para conectar al Cluster Lautaro, necesitas un cliente SSH para MS Windows, Linux y OSX

DATOS DE CONEXIÓN 

SERVIDOR : paliaike.ingmat.ufro.cl
PUERTO   : 20161

a) Usuarios de GNU/Linux:

 ssh -p 20161 user@paliaike.ingmat.ufro.cl                                # para conectarse a un terminal remoto del cluster
 scp -P 20161 -r archivo-local.zip user@paliaike.ingmat.ufro.cl:~user/    # upload desde computador local hacia el cluster



Para transferir archivos a través de una aplicación gráfica pueden usar FileZilla (https://filezilla-project.org/) o las alternativas que proporciona cada escritorio en Linux (gnome, kde, xfce, etc).

b) Usuarios de Microsoft Windows

Pueden descargar algun cliente SSH/SCP opensource como : putty, kitty, winscp. o un paquete portable de WinSCP integrado con kitty, listo para usar con el CEMCC.

DESCARGAR CLIENTE SSH PARA MS WINDOWS

  1. WinSCP-CEMCC http://cemcc.ufro.cl/files/WinSCP-CEMCC.exe
  2. Kitty Portable http://cemcc.ufro.cl/files/kitty_portable.exe
  3. Putty https://www.chiark.greenend.org.uk/~sgtatham/putty/latest.html
  4. WinSCP https://winscp.net/eng/download.php

En Windows 10 actualizado, disponen de un cliente por consola, para SSH y SCP.

  1. Inicio/Ejecutar/
  2. Ejecutar el comando cmd o powershell
  3. Se abrira una ventana con un prompt

Ejecutar: 

 ssh -p 20161 user@paliaike.ingmat.ufro.cl

Enviar trabajos al Cluster

Los 2 primeros métodos estan disponibles para enviar trabajos a procesar cualquier cómputo.

1.) Comando nohup

    nohup programa &                 # salida por pantalla y errores durante la ejecución al archivo de salida por default
    nohup programa 2> error.out&     # Envia solamente los errores durante la ejecución al archivo de salida error.out

Este comando envia “programa” en modo background, y la salida la envia a nohup.out por default (error y salida en pantalla)

2.) Multiplexor screen

     screen -S nombre-sesion                  #Crear una sesion de nombre "nombre-sesion"
     screen control+A+D                       #Desvincular el terminal de la sesion actual, para volver en otro momento...
     screen -list                             #Mostar las sesion abiertas activas
     screen -r nombre-trabajo                 #Restaurar una sesion previa

Más detalles : http://www.secnot.com/tutorial-screen.html

3.) Encolamiento (temporalmente fuera de servicio)

Uso de GPU

Para usar la GPU NVIDIA TESLA K40C en los cómputos tu programa debe estar escrito y soportar CUDA.

Esta disponible CUDA 8 y el compilador de NVIDIA para construir el soporte GPU adecuado.

Cada programa tiene su propio metodo y no de explicara cada uno en este documento.

Solamente está disponible el monitoreo a través del comando nvidia-smi, para estar seguro que la GPU esta procesadando tus datos.

(EN EDICIÓN…)