Existen dos métodos para utilizar un software:

1. Ingresado el nombre del software directamente en un terminal, si la utilidad o software está disponible se ejecuta directamente para trabajar, puedes ir directo a esta sección para ejecutar un trabajo con Screen
2. Si el método 1 falla, se deber verificar la disponibilidad del software y su versión exacta a través de la utilidad module

Module es una utilidad provista por el paquete Environment Modules, disponible en sistemas GNU/Linux, el cual carga todos los elementos necesarios para utilizar una librería o software, eliminando complejas configuraciones en las variables de entorno, y de esta forma permitiendo seleccionar versiones distintas de una aplicación o librería de forma simple.

Para utilizar un software específico instalado en el clúster se debe ejecutar la utilidad module. A continuación se presenta una guía básica para su uso habitual.

El comando ml (o bien module list) lista todos los módulos que estén cargados. El comando module avail lista todo el software disponible.

$ module avail

------------------------------------------------------------------- /usr/share/Modules/modulefiles --------------------------------------------------------------------
dot         module-git  module-info modules     null        use.own

-------------------------------------------------------------------------- /opt/modulefiles ---------------------------------------------------------------------------
cmake/3.15.4                               namd/Git-2019-11-27_Linux-x86_64-multicore python/3.7.4
gcc/5.5.0                                  netcdf/c-4.7.3-fortran-4.5.2               quantum-espresso/schrodinger-6.4.1-2019-4
gcc/8.3.0                                  openmpi/1.10.7                             R/3.6.1
gromacs/2019.4                             openmpi/1.6.5                              wrf/3.9.1
hdf5/1.10.5                                openmpi/2.1.6                              wrf/4.0
mpi                                        openmpi/3.1.5

[ETC...]

Seleccionar y cargar un módulo disponible con el comando module load [software]/[version]

Ejemplo:

Cargando el software Gromacs 2019.4, el cual a su vez carga el compilador gcc y openmpi de forma predefinida.

$ module load gromacs/2019.4

Loading gromacs/2019.4
  Loading requirement: gcc/8.3.0 openmpi/2.1.6

$ ml

Currently Loaded Modulefiles:
 1) gcc/8.3.0 <aL>   2) wrf/4.0   3) R/3.6.1   4) openmpi/2.1.6 <aL>   5) gromacs/2019.4

Revisando versión actual de Gromacs

$ gmx_mpi --version
                         :-) GROMACS - gmx, 2019.4 (-:

                            GROMACS is written by:
     Emile Apol      Rossen Apostolov      Paul Bauer     Herman J.C. Berendsen
    Par Bjelkmar      Christian Blau   Viacheslav Bolnykh     Kevin Boyd
 Aldert van Buuren   Rudi van Drunen     Anton Feenstra       Alan Gray

...

GROMACS version:    2019.4
Precision:          single
Memory model:       64 bit
MPI library:        thread_mpi

...

Cuando no necesitas más un software o librería específico, debes descargarlo con el comando module unload [software]/[version]

Ejemplo:

Descargando el software Gromacs 2019.4 que fue cargado en el ejemplo previo

$ ml

Currently Loaded Modulefiles:
 1) gcc/8.3.0 <aL>   2) wrf/4.0   3) R/3.6.1   4) openmpi/2.1.6 <aL>   5) gromacs/2019.4

$ module unload gromacs/2019.4

Unloading gromacs/2019.4
  Unloading useless requirement: openmpi/2.1.6 gcc/8.3.0

$ ml

Currently Loaded Modulefiles:
 1) gcc/8.3.0 <aL>   2) wrf/4.0   3) R/3.6.1

Eliminar todos los módulos que se tienen cargados previamente, con el comando module purge

Ejemplo:

$ ml

Currently Loaded Modulefiles:
 1) gcc/8.3.0 <aL>   2) wrf/4.0   3) R/3.6.1   4) openmpi/2.1.6 <aL>   5) gromacs/2019.4

$ module purge

$ ml

No Modulefiles Currently Loaded.